Вестник МГТУ, 2026, Т. 29, № 3.
Выводы В ходе исследования с помощью методов молекулярного моделирования была оценена способность двух биологически активных пептидов соевого происхождения IIVVQGKGAIGF и VIPPGVPYWTYNT ингибировать АПФ и ДПП-4. Оба пептида продемонстрировали высокую аффинность к исследуемым рецепторам. В отношении АПФ пептиды IIVVQGKGAIGF (-9,07±0,37 ккал/моль) и VIPPGVPYWTYNT (-10,46±0,30 ккал/моль) показали статистически значимо более сильное связывание по сравнению с референсным ингибитором каптоприлом (-5,40±0,21 ккал/моль; p < 0,001). В случае ДПП-4 пептид VIPPGVPYWTYNT (-8,56±0,25 ккал/моль) превзошел по аффинности ситаглиптин (-7,86±0,17 ккал/моль; p < 0,001), тогда как IIVVQGKGAIGF (-6,90±0,14 ккал/моль) уступал этому веществу. Анализ химических связей показал, что референсные препараты (каптоприл, ситаглиптин) демонстрировали высокую селективность, а большинство предсказанных контактов приходилось на остатки активного центра. Пептиды формировали большее общее число взаимодействий, однако лишь часть из них локализовались в каталитической зоне. Это указывает на то, что пептиды, обладая высокой общей аффинностью, вероятно, ингибируют активный центр хуже, чем эталонные препараты. Оба пептида формировали связи с различными остатками активных участков АПФ: TYR523, HIS410 и HIS387. Для взаимодействий с ДПП-4 не было обнаружено прямых контактов с описанными в литературе каталитическими участками, но были обнаружены контакты с рядом аминокислот в непосредственной близости к ним. Таким образом, оба пептида являются перспективными ингибиторами АПФ и ДПП-4. Это подтверждает перспективность их дальнейшего изучения в качестве функциональных ингредиентов в пищевых продуктах, а также их компонентов (в составе гидролизатов). Следует отметить, что количество выявленных межмолекулярных взаимодействий, визуализированных с помощью LigPlot+, может отличаться от данных, полученных в Discovery Studio Visualizer. Это связано с тем, что LigPlot+ использует более строгие геометрические критерии детекции связей. В данной работе количественный анализ и классификация межмолекулярных связей проводились на основе данных Discovery Studio Visualizer, обеспечивающих более полную характеристику взаимодействий, а LigPlot+ использовался для общей визуализации. Несмотря на благоприятные результаты, in silico интерпретация требует учета допущений метода: использование статичных кристаллических структур, упрощенное моделирование пептидов, отсутствие учета растворителя и динамики белка, конкуренции с точки зрения прочих субстратов. Полученные данные указывают на высокий потенциал пептидов, особенно VIPPGVPYWTYNT, в качестве перспективного натурального ингибитора АПФ и ДПП-4. Однако для подтверждения ингибирующей активности и оценки селективности необходим синтез пептидов и дальнейшие исследования in vitro и in vivo . Конфликт интересов Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. References Akbarian, M., Khani, A., Eghbalpour, S., Uversky, V. N. et al. 2022. Bioactive peptides: Synthesis, sources, applications, and proposed mechanisms of action. International Journal o fMolecular Sciences, 23(3). Article number: 1445. DOI: https://doi.org/10.3390/ijms23031445. Chhabria, S., Mathur, S., Vadakan, S., Sahoo, D. K. et al. 2022. A review on phytochemical and pharmacological facets of tropical ethnomedicinal plants as reformed DPP-IV inhibitors to regulate incretin activity. Frontiers in Endocrinology, 13. Article number: 1027237. DOI: https://doi.org/10.3389/fendo.2022.10272377. Cutrell, S., Alhomoud, I. S., Mehta, A., Talasaz, A. H. et al. 2023. ACE-Inhibitors in hypertension: A historical perspective and current insights. Current Hypertension Reportslogy, 25, pp. 243-250. DOI: https://doi.org/ 10.1007/s11906-023-01248-2. Du, Z., Comer, J., Li, Y. 2023. Bioinformatics approaches to discovering food-derived bioactive peptides: Reviews and perspectives. TrAC Trends in Analytical Chemistry, 162. Article number: 117051. DOI: https://doi.org/10.1016/j .trac.2023.117051. Fan, H., Liu, H., Zhang, Y., Zhang, S. et al. 2022. Review on plant-derived bioactive peptides: Biological activities, mechanism of action and utilizations in food development. Journal o fFuture Foods, 2(2), pp. 143-159. DOI: https://doi.org/10.1016/jjfutfo.2022.03.003. Fang, Z., Zhang, M., Lian, J., Xiao, Y. et al. 2025. Uncovering novel DPP-IV inhibitory peptides from amphibian (Lithobates catesbeiana) skin via peptidomics and molecular simulation. Foods, 14(17). Article number: 3023. DOI: https://doi.org/10.3390/foods14173023. Fomenko, V. V., Detinkin, I. A., Chernukha, I. M., Mashentseva, N. G. et al. 2026. Study of soy protein proteolysis by digestive enzymes and description of the peptide profile of the resulting hydrolysates. Problems o fNutrition, 95(2(564)), pp. 70-91. (In Russ.) = Фоменко В. В., Детинкин И. А., Чернуха И. М., Машенцева Н. Г. [и др.]. Изучение протеолиза соевого белка пищеварительными ферментами и описание пептидного профиля полученных гидролизатов // Вопросы питания. 2026. Т. 95, № 2(564). С. 70-91. DOI: https://doi.org/10.33029/0042-8833-2026-95-2-70-91. EDN: LCTYQG.
Made with FlippingBook
RkJQdWJsaXNoZXIy MTUzNzYz