Вестник МГТУ, 2026, Т. 29, № 3.
Взаимодействие VIPPGVPYWTYNT сДПП-4 Для лиганда VIPPGVPYWTYNT при докинге с ДПП-4 обнаружено 20 межмолекулярных взаимодействий: 9 водородных связей, 8 гидрофобных контактов и 3 электростатических взаимодействия. Водородные связи образованы с участием атомов остатков ASP739 (2 контакта, 1,76-2,69 А), GLN123 (2 контакта, 2,66-3,05 А), TYR211 (2 контакта, 1,80-2,87 А), GLY741 (3,34 А), ALA743 (3,35 А) и ASN170 (3,72 А). При этом контакт THR13-ASP739 (1,76 А) является наиболее коротким и потенциально наиболее прочным водородным взаимодействием среди всех проанализированных лигандов. Электростатические взаимодействия зафиксированы с остатками ASP243 (2 контакта с TRP9, 4,16-4,37 А) и ASP739 (4,09 А). Гидрофобные контакты обнаружены с остатками PHE240 (2 контакта, 4,46-5,10 А), VAL121 (5,23 А), LYS250 (4,15 А), VAL252 (4,81 А), TRP124 (5,30 А), TYR195 (5,13 А) и ALA707 (4,69 А). Наибольшее число контактов отмечено с остатком ASP739 (3 взаимодействия), который расположен в непосредственной близости от каталитического гистидина HIS740. VIPPGVPYWTYNT так же, как и IIVVQGKGAIGF, был менее селективен к активному центру, чем ситаглиптин. Визуализация представлена на рис. 7.
Made with FlippingBook
RkJQdWJsaXNoZXIy MTUzNzYz