Вестник МГТУ, 2026, Т. 29, № 3.

комплексов фермента-ингибитора. Остаток TRP629 образует каталитический карман в ДПП-4, а TYR547 стабилизирует оксианион в каталитическом центре (Fang et al., 2025; Mathur et al., 2023). Пептиды IIVVQGKGAIGF и VIPPGVPYWTYNT были обнаружены в гидролизатах соевого белка, обработанных последовательным гидролизом трипсином/пепсином и отдельно пепсином (обе последовательности присутствуют в различных субъединицах глицинина сои). Молекулярная масса пептидов составляла 1200 и 1506 Да соответственно. Для них были спрогнозированы свойства ингибировать АПФ и ДПП-4 при помощи базы данных BIOPEP-UWM в нашей прошлой работе (Фоменко и др., 2026). Результаты и обсуждение Анализ аффинности пептидов кДПП-4 и АПФ В ходе работы были проанализированы энергии связывания пептидов IIVVQGKGAIGF и VIPPGVPYWTYNT с АПФ и ДПП-4. В качестве эталонных молекул использовали каптоприл и ситаглиптин. В табл. 1 представлены энергии связывания используемых рецепторов с пептидами и эталонными молекулами. Таблица 1. Энергии связывания изучаемых молекул с ДПП-4 и АПФ Table 1. Binding energies of the studied molecules with DPP-4 and ACE Рецептор АПФ ДШ1-4 Модели Каптоприл IIVVQGKG AIGF VIPPGVPYW TYNT Ситаглиптин IIVVQGKG AIGF VIPPGVPYW TYNT Энергия связывания, ккал/моль 1 -5,601 -9,605 -10,945 -8,020 -7,119 -8,956 2 -5,595 -9,570 -10,699 -8,020 -7,042 -8,851 3 -5,496 -9,320 -10,607 -8,007 -7,016 -8,795 4 -5,451 -8,862 -10,466 -7,933 -6,938 -8,524 5 -5,409 -8,850 -10,364 -7,871 -6,883 -8,466 6 -5,344 -8,824 -10,329 -7,856 -6,801 -8,448 7 -5,187 -8,812 -10,229 -7,825 -6,796 -8,390 8 -5,110 -8,725 -10,076 -7,622 -6,760 -8,334 9 -4,997 -8,660 -10,042 -7,552 -6,734 -8,271 Среднее -5,399 -9,071 -10,464 -7,856 -6,899 -8,559 Отклонение 0,214 0,369 0,296 0,170 0,137 0,246 t-критерий - 1,86-10-12 1,4610-16 - 9,3610-10 5,1810-6 Анализ энергии связывания по 9 независимым моделям показал, что для АПФ оба пептида продемонстрировали большую аффинность, чем референсный препарат каптоприл, причем различия были существенно значимые в сравнении с эталоном согласно t-тесту Стьюдента с двумя независимыми выборками. Пептид IIVVQGKGAIGF продемонстрировал меньшую аффинность, чем ситаглиптин, причем различие в сравнении с эталоном являлось существенно значимым. В то же время пептид VIPPGVPYWTYNT показал большую аффинность, чем ситаглиптин. Стандартное отклонение в контексте анализа демонстрирует, насколько результаты схожи друг с другом: чем меньше значение, тем сильнее независимые анализы совпадают по энергии связывания. Наименьшее отклонение наблюдалось у пептида IIVVQGKGAIGF с ДПП-4, что, вероятно, обусловлено размером этой молекулы относительно активного центра. Анализ межмолекулярных взаимодействий с АПФ Подробная характеристика взаимодействия пептидов и референсного препарата каптоприла с каталитическим центром рецептора АПФ представлена в табл. 2. Таблица 2. Характеристики связывания лигандов с АПФ Table 2. Binding characteristics of ligands with ACE Лиганд Всего связей Связи с активным центром и вблизи него Диапазон расстояний (А) Каптоприл 10 TYR523 (1 водородная связь, 1 гидрофобное взаимодействие) HIS353 (1 водородная связь) HIS513 (1 водородная связь) PHE457 (1 гидрофобное взаимодействие) ALA354 (1 гидрофобное взаимодействие) VAL380 (1 гидрофобное взаимодействие) HIS383 (1 гидрофобное взаимодействие) PHE527 (1 гидрофобное взаимодействие) 2,81-4,66